Pile-ups (DNA-Genealogie): Unterschied zwischen den Versionen
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Bei Matche, die in diesen Regionen auftreten handelt es sich häufig um '''falsche Matche''', die entstehen, weil der Match zwischen dem mütterlichen und dem väterlichen Chromosom hin- und herspringt ([[Zick-Zack-Match_(DNA-Genealogie)|Zick-Zack-Match]]). Bei einem [[Phasing|gephasten]] Datensatz ist dann kein Match vorhanden. | |||
Ob Matche in den Bereichen der nachfolgenden Tabelle angezeigt werden, ist auch abhängig von dem Testanbieter, da andere Positionen getestet werden und teilweise ein fehlerhafter Algorithmus angewendet wird. | |||
So werden z.B. beim Testanbieter MyHeritage am Anfang von Chromosom 15 Matche angezeigt, obwohl zu wenige Positionen getestet sind. Nachfolgend vier Beispiele: | |||
Positionen 20.004.966 bis 22.852.884 - 14,1 cM, 128 SNPs, es werden jedoch nur 38 SNPs getestet. | |||
Positionen 20.004.966 bis 23.004.417 - 14,7 cM, 256 SNPs, es werden jedoch nur 94 SNPs getestet. | |||
Positionen 20.004.966 bis 23.683.783 - 19,5 cM, 384 SNPs, es werden jedoch nur 137 SNPs getestet. | |||
Positionen 20.004.966 bis 23.890.279 - 20,1 cM, 512 SNPs, es werden jedoch nur 197 SNPs getestet. | |||
Die getesteten [[SNP|SNPs]] können sich durch [[No-call (DNA-Genealogie)|No-calls]] um ca. 10% verringern. | |||
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Aktuelle Version vom 5. Dezember 2020, 14:09 Uhr
Als Pile-ups werden in der DNA-Genealogie Regionen bzw. Segmente auf den autosomalen Chromosomen bezeichnet in denen sehr viele Matche auftreten, die jedoch meistens unter 7 cM liegen.
Bei Matche, die in diesen Regionen auftreten handelt es sich häufig um falsche Matche, die entstehen, weil der Match zwischen dem mütterlichen und dem väterlichen Chromosom hin- und herspringt (Zick-Zack-Match). Bei einem gephasten Datensatz ist dann kein Match vorhanden.
Ob Matche in den Bereichen der nachfolgenden Tabelle angezeigt werden, ist auch abhängig von dem Testanbieter, da andere Positionen getestet werden und teilweise ein fehlerhafter Algorithmus angewendet wird.
So werden z.B. beim Testanbieter MyHeritage am Anfang von Chromosom 15 Matche angezeigt, obwohl zu wenige Positionen getestet sind. Nachfolgend vier Beispiele:
Positionen 20.004.966 bis 22.852.884 - 14,1 cM, 128 SNPs, es werden jedoch nur 38 SNPs getestet.
Positionen 20.004.966 bis 23.004.417 - 14,7 cM, 256 SNPs, es werden jedoch nur 94 SNPs getestet.
Positionen 20.004.966 bis 23.683.783 - 19,5 cM, 384 SNPs, es werden jedoch nur 137 SNPs getestet.
Positionen 20.004.966 bis 23.890.279 - 20,1 cM, 512 SNPs, es werden jedoch nur 197 SNPs getestet.
Die getesteten SNPs können sich durch No-calls um ca. 10% verringern.
Artikel wird demnächst ergänzt.
Bekannte Pile-ups Regionen
| Chromosom | Startposition | Endposition | Centimorgan |
| 1 | 118.434.520 | 153.401.108 | 10,0 |
| 2 | 85.304.243 | 99.558.013 | 6,5 |
| 2 | 132.695.025 | 141.442.636 | 9,2 |
| 2 | 192.352.906 | 198.110.229 | 5,0 |
| 8 | 10.428.647 | 13.469.693 | 8,0 |
| 9 | 38.293.483 | 72.605.261 | 8,2 |
| 10 | 44.555.093 | 53.240.188 | 7,6 |
| 15 | 20.060.673 | 25.145.260 | 10,5 |
| 15 | 27.115.823 | 30.295.750 | 9,3 |
| 16 | 19.393.068 | 24.031.556 | 6,2 |
| 17 | 59.518.083 | 64.970.531 | 6,2 |
| 17 | 77.186.666 | 78.417.478 | 5,7 |
| 21 | 16.344.186 | 19.375.168 | 6,9 |
| 22 | 16.051.881 | 25.095.451 | 20,8 |
Anmerkungen
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