DNA-Tools: Unterschied zwischen den Versionen
Keine Bearbeitungszusammenfassung |
(+ WATO-Tool) |
||
| (14 dazwischenliegende Versionen von 3 Benutzern werden nicht angezeigt) | |||
| Zeile 1: | Zeile 1: | ||
{{Rückverweis|Portal:DNA-Genealogie}} | {{Rückverweis|Portal:DNA-Genealogie}} | ||
[https://stonefamilytree.wordpress.com/2014/11/02/steps-to-dna-matching-and-chromosome-mapping-success-with-gedmatch-and-genome-mate/#more-1561 | '''Besonders wichtig:''' | ||
[https://www.gedmatch.com GedMatch]: Ein '''Muss''' für jeden, der sich mit [[DNA-Genealogie]] beschäftigt. Datenbank zum Vergleich von DNA-Tests verschiedener Anbieter. Es ist dringend zu empfehlen, die Testergebnisse von FTDNA, Ancestry oder 23andMe zu [[GedMatch|GEDmatch]] zu übertragen, um die eigenen Ergebnisse mit Tests zu vergleichen, die bei anderen Anbietern vorgenommen worden sind. Die grundlegenden Vergleiche sind kostenlos; speziellere Analysetools für Fortgeschrittene ("Tier 1 members") kosten 10 $ / Monat, sind aber voll und ganz ihr Geld wert. | |||
[https://dnagenics.com/dna-kit-studio/ DNA Kit Studio]: Das "DNA Kit Studio" ist ein sehr hilfreiches Werkzeug zur Bearbeitung von Rohdaten: Analyse von Rohdaten (Anzahl der SNP, Anzahl der no-calls etc.); Verschmelzen von mehreren DNA-Kits (Erstellung eines kombinierten Kits mit den Analysedaten mehrerer verschiedener Anbieter; Umformatierung von Rohdaten eines Anbieters in das Format eines anderen Anbieters). | |||
[https://dnapainter.com/ DNA-Painter]: Mit dem DNA-Painter kann man DNA-Segmente Vorfahren zuordnen und graphisch darstellen. Unter den "Tools" findet sich das [https://dnapainter.com/tools/sharedcmv4 "Shared cM Tool"], mit dem man zu einem gegebenen cM die möglichen Verwandtschaftsverhältnisse angezeigt bekommt (mit Angaben zur Häufigkeit bzw. Wahrscheinlichkeit). Siehe [[DNA-Painter]]. | |||
[https://dnapainter.com/tools/probability/ WATO-Tool des DNA-Painter] Mit diesem Werkzeug kann man mithilfe verschiedener Hypothesen ein Verwandtschaftsverhältnis zu einer unbekannten Person in der DNA-Datenbank herstellen. Eine deutsche Anleitung hat Eleonora Haas geschrieben: [http://geneticgenealogygirl.com/de/2020/03/eine-anleitung-fuer-das-wato-tool/ Eine Anleitung für das WATO-Tool] | |||
[https://borlandgenetics.com/ Borland Genetics]: "Borland Genetics" ist ein leistungsfähiges Programm, um Rohdaten zu bearbeiten. Es bietet vor allem verschiedene Tools zum Phasing und zum Verschmelzen von Dateien, die es ermöglichen, "virtuelle Kits" (etwa von Großeltern oder Urgroßeltern), die auch zu Gedmatch hochgeladen werden können. | |||
[https://getgmp.com/ Genome Mate Pro]: Außerordentlich nützliches Programm zur Auswertung der DNA-Analyseergebnisse, zur Verwaltung der Matches, zur Dokumentierung der Herkunft einzelner DNA-Abschnitte. Für jeden dringend zu empfehlen, der sich mit DNA-Genealogie und Matching beschäftigt. - Hier außerdem [https://stonefamilytree.wordpress.com/2014/11/02/steps-to-dna-matching-and-chromosome-mapping-success-with-gedmatch-and-genome-mate/#more-1561 wichtige Anleitungen zur Arbeit mit GedMatch und Genome Mate Pro (englisch)] mit mehreren Einzelanleitungen zu beiden Tools. | |||
[https://www.dnagedcom.com DNAGedcom]: Zahlreiche Analyse- und Vergleichsmöglichkeiten; zu nennen ist v.a. der Autosomal DNA Segment Analyzer. Grundsätzlich auch sehr hilfreich, muss aber teilweise an Änderungen bei FTDNA etc. angepasst werden. Manche Funktionen sind inzwischen kostenpflichtig. | |||
[http://compgen.rutgers.edu/map_interpolator.shtml Map Interpolator]: Mit dem Map Interpolator lässt sich die Länge von DNA-Segmenten in cM errechnen, wenn Anfangs- und Endposition bekannt sind. | |||
'''Weitere Tools:''' | '''Weitere Tools:''' | ||
[http://blog.kittycooper.com/tools/my-graphing-or-mapping-tools/ Kitty Cooper’s Tools]: | * [http://blog.kittycooper.com/tools/my-graphing-or-mapping-tools/ Kitty Cooper’s Tools]: Mehrere nützliche Tools, am wichtigsten der Ancestor Chromosome Mapper. | ||
* [http://www.math.mun.ca/~dapike/FF23utils/ David Pike]: Diverse Analysetools zur Analyse der Rohdaten verschiedener Anbieter. | |||
* [http://www.y-str.org/p/tools-utilities.html Genetic Genealogy Tools]: Diverse Analyseprogramme für unterschiedliche Aufgaben. | |||
* [http://goldenhelix.com/products/GenomeBrowse/index.html GenomeBrowse]: Chromosomenweise Visualisierung der Analyseergebnisse. | |||
* [https://opensnp.org openSNP]: In openSNP kann jeder die Ergebnisse seines Gentests veröffentlichen. Ziel ist es, andere Teilnehmer mit ähnlichen genetischen Varianten zu finden, die neueste wissenschaftliche Literatur dazu zu erhalten und Wissenschaftler bei der Suche nach neuen Verbindungen zu unterstützen. | |||
== Siehe auch == | |||
[ | * [[Chromosomen-Browser]] | ||
== Anmerkungen == | |||
<references /> | |||
{{DNA-GenealogieHinweis}} | {{DNA-GenealogieHinweis}} | ||
[[Kategorie:Hilfsprogramm]] | |||
Aktuelle Version vom 5. März 2020, 16:52 Uhr
Besonders wichtig:
GedMatch: Ein Muss für jeden, der sich mit DNA-Genealogie beschäftigt. Datenbank zum Vergleich von DNA-Tests verschiedener Anbieter. Es ist dringend zu empfehlen, die Testergebnisse von FTDNA, Ancestry oder 23andMe zu GEDmatch zu übertragen, um die eigenen Ergebnisse mit Tests zu vergleichen, die bei anderen Anbietern vorgenommen worden sind. Die grundlegenden Vergleiche sind kostenlos; speziellere Analysetools für Fortgeschrittene ("Tier 1 members") kosten 10 $ / Monat, sind aber voll und ganz ihr Geld wert.
DNA Kit Studio: Das "DNA Kit Studio" ist ein sehr hilfreiches Werkzeug zur Bearbeitung von Rohdaten: Analyse von Rohdaten (Anzahl der SNP, Anzahl der no-calls etc.); Verschmelzen von mehreren DNA-Kits (Erstellung eines kombinierten Kits mit den Analysedaten mehrerer verschiedener Anbieter; Umformatierung von Rohdaten eines Anbieters in das Format eines anderen Anbieters).
DNA-Painter: Mit dem DNA-Painter kann man DNA-Segmente Vorfahren zuordnen und graphisch darstellen. Unter den "Tools" findet sich das "Shared cM Tool", mit dem man zu einem gegebenen cM die möglichen Verwandtschaftsverhältnisse angezeigt bekommt (mit Angaben zur Häufigkeit bzw. Wahrscheinlichkeit). Siehe DNA-Painter.
WATO-Tool des DNA-Painter Mit diesem Werkzeug kann man mithilfe verschiedener Hypothesen ein Verwandtschaftsverhältnis zu einer unbekannten Person in der DNA-Datenbank herstellen. Eine deutsche Anleitung hat Eleonora Haas geschrieben: Eine Anleitung für das WATO-Tool
Borland Genetics: "Borland Genetics" ist ein leistungsfähiges Programm, um Rohdaten zu bearbeiten. Es bietet vor allem verschiedene Tools zum Phasing und zum Verschmelzen von Dateien, die es ermöglichen, "virtuelle Kits" (etwa von Großeltern oder Urgroßeltern), die auch zu Gedmatch hochgeladen werden können.
Genome Mate Pro: Außerordentlich nützliches Programm zur Auswertung der DNA-Analyseergebnisse, zur Verwaltung der Matches, zur Dokumentierung der Herkunft einzelner DNA-Abschnitte. Für jeden dringend zu empfehlen, der sich mit DNA-Genealogie und Matching beschäftigt. - Hier außerdem wichtige Anleitungen zur Arbeit mit GedMatch und Genome Mate Pro (englisch) mit mehreren Einzelanleitungen zu beiden Tools.
DNAGedcom: Zahlreiche Analyse- und Vergleichsmöglichkeiten; zu nennen ist v.a. der Autosomal DNA Segment Analyzer. Grundsätzlich auch sehr hilfreich, muss aber teilweise an Änderungen bei FTDNA etc. angepasst werden. Manche Funktionen sind inzwischen kostenpflichtig.
Map Interpolator: Mit dem Map Interpolator lässt sich die Länge von DNA-Segmenten in cM errechnen, wenn Anfangs- und Endposition bekannt sind.
Weitere Tools:
- Kitty Cooper’s Tools: Mehrere nützliche Tools, am wichtigsten der Ancestor Chromosome Mapper.
- David Pike: Diverse Analysetools zur Analyse der Rohdaten verschiedener Anbieter.
- Genetic Genealogy Tools: Diverse Analyseprogramme für unterschiedliche Aufgaben.
- GenomeBrowse: Chromosomenweise Visualisierung der Analyseergebnisse.
- openSNP: In openSNP kann jeder die Ergebnisse seines Gentests veröffentlichen. Ziel ist es, andere Teilnehmer mit ähnlichen genetischen Varianten zu finden, die neueste wissenschaftliche Literatur dazu zu erhalten und Wissenschaftler bei der Suche nach neuen Verbindungen zu unterstützen.
Siehe auch
Anmerkungen
|
|